微生物水分析包括各种分析以识别特定微生物。 这些包括大肠杆菌，粪大肠菌群，总大肠菌群，亚硫酸盐还原梭菌，粪链球菌，异养活菌计数和假单胞菌金黄色葡萄球菌。 大肠杆菌，总大肠菌群和粪大肠菌群是水中最常见的微生物。

用于细菌水分析的样品量取决于水的脏污程度。 如果水的总大肠菌群分析是阳性的，则有必要分析其他一些特定细菌的水分。 这些细菌是粪大肠杆菌和大肠杆菌。 粪大肠杆菌是动物和人类肠道特有的细菌。 需要不同的分析来检测它们。 在水中单独检测大肠杆菌比检测总大肠菌更重要，因为大肠杆菌表明动物或人类粪便已被水污染。

有数百种不同的大肠杆菌，但其中许多对人体健康无害。 只有老年人，儿童和有免疫系统问题的人才会引起严重的不适。

在微生物水分析中检测和检测大肠杆菌和总大肠菌的所有标准方法都是针对大肠杆菌。 这些方法包括最可能数量（EMS）方法，固体培养基方法和膜过滤方法以及快速分析方法。

快速分析方法基于颜色变化。 观察试管中的颜色变化并获得结果。 该方法以快速且简单的方式提供关于水中大肠杆菌存在或不存在的信息。 如果该方法的结果为阳性，则100 ml水样至少含有1大肠杆菌。 然而，用这种方法不能理解感染的原因，并且不能开发出解决方案。

在微生物分析范围内，在授权实验室中检测大肠菌群的快速检测方法中进行了研究。