应用于新鲜食物的储存方法之一是冷冻。 冷冻食品中的微生物生长通常在包装后发生。 如果没有适当地考虑冷链条件，则再现冷冻食品中消耗的微生物。 此外，由于在该过程中不遵守卫生规则，粪便微生物很容易传播到食品中。

食品部门中的某些微生物被接受作为生产是否按照规则进行的指标。 在一些研究中，人们认为这些指示微生物应该是粪便来源，并且在一些研究中，所有种类的微生物都是指标。

肠球菌，粪大肠杆菌，产气荚膜梭菌和大肠杆菌是粪便污染的指征。 粪链球菌也包括在该组中。 动物中肠球菌的存在增加了肉类屠宰场的传播潜力。 肠球菌不仅存在于温血动物中，还存在于土壤，地表水和植物和蔬菜中。

肠球菌属物种是粪便来源，可以在水中繁殖。 在干燥和冷冻条件下，肠球菌显示出比指示大肠杆菌更高的抗性。 因此，肠球菌属于微生物标准，是许多食品中的直接粪便污染指标，包括冷冻蔬菜和冰淇淋。 与冷冻鱼产品中的大肠菌群和肠球菌相比，肠球菌的数量明显更优。

食品中肠球菌的存在并不一定表明食物被粪便污染。 虽然这些细菌存在于人类和动物的消化系统中，但它们在自然界中非常常见。 但是，如果在水样中检测到大量肠球菌，则表明粪便污染。

粪链球菌和肠球菌细菌计数在微生物分析范围内的先进实验室中进行。 在这些研究期间，遵循国内和国外组织发布的标准和测试方法。