Одним из способов хранения свежих продуктов является замораживание. Микробный рост в замороженных пищевых продуктах обычно происходит после упаковки. Если условия холодной цепи не соблюдаются должным образом, воспроизводятся микроорганизмы в замороженных пищевых продуктах. Кроме того, фекальные микроорганизмы легко передаются в пищу из-за несоблюдения правил гигиены во время процесса.

Определенные микроорганизмы в пищевом секторе принимаются в качестве индикатора того, осуществляется ли производство в соответствии с правилами. В некоторых исследованиях принято, что эти индикаторные микроорганизмы должны быть фекального происхождения, а в некоторых исследованиях принято, что все виды микроорганизмов являются индикаторами.

Энтерококки, фекальные кишечные палочки, clostridium perfringens и escherichia coli являются признаками фекального загрязнения. К этой группе также относятся фекальные бактерии стрептококка. Присутствие энтерококковых бактерий у животных увеличивает потенциал передачи на мясных скотобойнях. Энтерококковые бактерии встречаются не только у теплокровных животных, но и в почве, поверхностных водах, растениях и овощах.

Энтерококковые виды бактерий имеют фекальное происхождение и могут размножаться в воде. Энтерококки проявляют более высокую устойчивость, чем индикаторные колиподобные бактерии, в условиях сушки и замораживания. Следовательно, энтерококки являются одним из микробиологических критериев как индикатор прямого фекального загрязнения во многих пищевых продуктах, включая замороженные овощи и мороженое. По сравнению с кишечной группой и энтерококками в замороженных рыбных продуктах энтерококки значительно превосходят по количеству.

Наличие энтерококков в пищевых продуктах не обязательно указывает на то, что пища загрязнена калом. Хотя эти бактерии находятся в пищеварительной системе человека и животных, они очень распространены в природе. Однако, если в пробах воды обнаружено большое количество энтерококков, это указывает на фекальное загрязнение.

Подсчет фекальных стрептококков и бактерий энтерококка проводится в передовых лабораториях в рамках микробиологических анализов. В ходе этих исследований соблюдаются стандарты и методы испытаний, выпущенные отечественными и зарубежными организациями.