Λόγω της δομής των καλλυντικών προϊόντων, οι μικροοργανισμοί μπορούν εύκολα να αναπτυχθούν σε αυτά. Αυτό μπορεί να συμβαίνει για τα ανοιγμένα και τα χρησιμοποιημένα καλλυντικά προϊόντα καθώς και για τα προϊόντα που δεν έχουν ακόμη ανοιχθεί. Επειδή σε καλλυντικά προϊόντα, υδατάνθρακες, αλκοόλες σακχάρων, πρωτεΐνες, μέταλλα, λιπαρά οξέα, αμινοξέα, βιταμίνες και νερό, και αυτό το περιβάλλον είναι πολύ κατάλληλο για την ανάπτυξη μικροοργανισμών.

Ένας από τους πιο συνηθισμένους μικροοργανισμούς στα καλλυντικά προϊόντα είναι ο Staphylococcus Aureus. Αυτός ο μικροοργανισμός, όπως οι ομολόγοι του, θέτει σε κίνδυνο για τους χρήστες. Ενώ ορισμένοι μικροοργανισμοί που υπάρχουν στα καλλυντικά προϊόντα προκαλούν μόνο υποβάθμιση των προϊόντων, ο Staphylococcus Aureus προκαλεί μεγάλες οικονομικές απώλειες στους κατασκευαστές και σοβαρή δυσφορία για τους χρήστες. Για την παραγωγή υγιεινών καλλυντικών προϊόντων πρέπει να τηρούνται οι συνθήκες υγιεινής.

Κρέμες, λοσιόν, σκόνες και σαμπουάν είναι τα πιο ευαίσθητα προϊόντα για την ανάπτυξη μικροοργανισμών. Μεταξύ αυτών, η περιεκτικότητα σε νερό είναι πολύ υψηλή και είναι πολύ κατάλληλη για την ανάπτυξη βακτηριδίων εάν δεν παρέχεται κατάλληλη προστασία. Τα κονιοποιημένα προϊόντα όπως οι σκιές των ματιών και οι σκόνες παράγουν επίσης μικροοργανισμούς ανάλογα με τις περιβαλλοντικές συνθήκες.

Η μικροβιολογική ποιότητα των καλλυντικών προϊόντων προσδιορίζεται με την καταμέτρηση βακτηρίων, μούχλας και ζύμης. Διάφορες χώρες έχουν αναπτύξει διαφορετικά πρότυπα στο θέμα αυτό. Για παράδειγμα, στις Ηνωμένες Πολιτείες, η Ένωση Καλλυντικών Κατασκευαστών (CTFA) θέσπισε μικροβιολογικά όρια ποιότητας για τα καλλυντικά προϊόντα και οι κατασκευαστές πρέπει να συμμορφώνονται με αυτές τις απαιτήσεις. Επιπλέον, τα βακτηρίδια Staphylococcus Aureus δεν πρέπει να υπάρχουν σε καλλυντικά προϊόντα καθώς και σε άλλα επικίνδυνα βακτήρια.

Οι μικροβιολογικές επιθεωρήσεις των καλλυντικών προϊόντων διεξάγονται αυστηρά σε κάθε χώρα. Τα προϊόντα που δεν πληρούν αυτά τα κριτήρια συλλέγονται από τις αγορές. Πολλά προϊόντα έχουν ανακληθεί σε χώρες της Ευρωπαϊκής Ένωσης λόγω μικροοργανισμών που ανιχνεύονται στα αχρησιμοποίητα καλλυντικά προϊόντα.

Τα διαπιστευμένα εργαστήρια διεξάγουν επίσης την αναζήτηση βακτηρίων Staphylococcus Aureus στο πλαίσιο των μελετών μικροβιολογικής ανάλυσης. Ένα από τα πρότυπα που βασίζονται σε αυτές τις μελέτες είναι το πρότυπο αναζήτησης TS EN ISO 22718 Cosmetics - Microbiology - Staphylococcus Aureus.