Μία από τις μεθόδους αποθήκευσης που εφαρμόζονται σε νωπά τρόφιμα είναι η κατάψυξη. Η μικροβιακή ανάπτυξη στα κατεψυγμένα τρόφιμα συνήθως συμβαίνει μετά τη συσκευασία. Εάν οι συνθήκες ψυχρής αλυσίδας δεν τηρούνται σωστά, αναπαράγονται οι μικροοργανισμοί στα κατεψυγμένα τρόφιμα που καταναλώνονται. Επιπλέον, οι μικροοργανισμοί των κοπράνων μεταφέρονται εύκολα στα τρόφιμα λόγω μη τήρησης των κανόνων υγιεινής κατά τη διάρκεια της διαδικασίας.

Ορισμένοι μικροοργανισμοί στον τομέα των τροφίμων γίνονται δεκτοί ως δείκτες για το κατά πόσον η παραγωγή πραγματοποιείται ή όχι σύμφωνα με τους κανόνες. Σε μερικές μελέτες, είναι αποδεκτό ότι αυτοί οι μικροοργανισμοί δείκτες πρέπει να προέρχονται από κοπριά και σε μερικές μελέτες είναι αποδεκτό ότι όλα τα είδη μικροοργανισμών είναι δείκτες.

Οι εντερόκοκκοι, κολοβακτηρίδια κοπράνων, clostridium perfringens και escherichia coli είναι ενδείξεις μόλυνσης από κοπράνες. Σ 'αυτή την ομάδα περιλαμβάνονται επίσης βακτήρια κοπράνων στρεπτόκοκκου. Η παρουσία εντεροκοκκικών βακτηριδίων σε ζώα αυξάνει το δυναμικό μετάδοσης στα σφαγεία κρέατος. Τα εντεροκοκκικά βακτήρια βρίσκονται όχι μόνο σε θερμόαιμα ζώα, αλλά και στο έδαφος, τα επιφανειακά νερά και τα φυτά και τα λαχανικά.

Τα είδη βακτηρίων Enterococcus προέρχονται από κοπριά και μπορούν να αναπαραχθούν στο νερό. Οι εντερόκοκκοι παρουσιάζουν μεγαλύτερη αντοχή από τα δείγματα κολοβακτηριδίων υπό συνθήκες ξήρανσης και κατάψυξης. Ως εκ τούτου, οι εντερόκοκκοι συγκαταλέγονται στα μικροβιολογικά κριτήρια ως δείκτης άμεσης μόλυνσης κοπράνων σε πολλά τρόφιμα, συμπεριλαμβανομένων των κατεψυγμένων λαχανικών και του παγωτού. Σε σύγκριση με την ομάδα των κολοβακτηριδίων και τους εντερόκοκκους σε κατεψυγμένα προϊόντα ψαριών, οι εντερόκοκκοι είναι σημαντικά ανώτεροι σε αριθμό.

Η παρουσία εντεροκόκκων στα τρόφιμα δεν σημαίνει απαραίτητα ότι τα τρόφιμα είναι μολυσμένα με κόπρανα. Ενώ αυτά τα βακτήρια βρίσκονται στα πεπτικά συστήματα των ανθρώπων και των ζώων, είναι πολύ κοινά στη φύση. Ωστόσο, αν ανιχνευθούν υψηλοί αριθμοί εντεροκόκκων σε δείγματα νερού, αυτό υποδηλώνει μόλυνση από κοπράνες.

Οι μετρήσεις των βακτηριδίων των κοπράνων στρεπτόκοκκου και εντεροκόκκων πραγματοποιούνται σε προηγμένα εργαστήρια στο πλαίσιο μικροβιολογικών αναλύσεων. Κατά τη διάρκεια αυτών των μελετών, τηρούνται τα πρότυπα και οι μέθοδοι δοκιμών που εκδίδονται από εγχώριες και ξένες οργανώσεις.